J’ai eu le droit à petite surprise après avoir installé EasyTAG.

À chaque fois que j’utilisais un raccourci du menu “Places”, GNOME m’ouvrait non pas Nautilus mais… EasyTAG.

Cela est du à un fichier mimetype.cache incorrect, vous pouvez voir quelques sujets comme :

https://bbs.archlinux.org/viewtopic.php?id=69035

Néanmoins, la solution update-safe côté utilisateur avec xdg-mime est :

xdg-mime default org.gnome.Nautilus.desktop inode/directory